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Cartographie cellulaire dans le corps humain: avantages pour la recherche sur les maladies

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Anonim

Pour vos prochaines vacances, essayez d'abandonner votre GPS et votre smartphone.

Au lieu de cela, conduisez à travers le pays en utilisant l'une de ces cartes que vous avez coloriées à l'école primaire. Il y a probablement tous les états et peut-être quelques rivières et lacs.

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Bien sûr, il pourrait être plus facile de vous rendre là où vous vous rendez si vous aviez quelques détails de plus - comme les rues et les routes, et même les péages.

Maintenant, imaginez ce que ce serait de trouver votre chemin autour du corps humain avec seulement un croquis de ses trillions de cellules.

C'est le problème que rencontrent les scientifiques qui essaient de comprendre et de trouver de nouveaux traitements pour des maladies comme le cancer, la maladie d'Alzheimer et l'asthme.

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Mais un nouveau projet ambitieux annoncé au début de ce mois à Londres pour construire une carte complète du corps humain espère donner aux chercheurs une petite aide à la navigation.

"La cellule est la clé pour comprendre la biologie de la santé et de la maladie, mais nous sommes actuellement limités dans notre compréhension de la façon dont les cellules diffèrent dans chaque organe, ou même combien de types de cellules dans le corps. corps, "Sarah Teichmann, Ph. D., chef de la génétique cellulaire à l'Institut Sanger, a déclaré dans un communiqué de presse pour la réunion.

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Lire la suite: À quoi pourrait servir un génome humain synthétique? »

Carte détaillée du corps humain

De nombreuses ressources scientifiques répertorient environ 200 types différents de cellules dans le corps humain - telles que la peau, le cœur et les cellules musculaires.

En regroupant les trillions de cellules du corps en groupes importants, vous perdez beaucoup de détails.

Une grande partie de la recherche médicale est effectuée de la même manière, les chercheurs examinant l'activité cellulaire moyenne dans un tissu plutôt que la variation qui se produit dans tout le tissu.

L'Atlas des cellules humaines effectue un zoom sur la carte, jusqu'au niveau de la cellule individuelle.

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Il inclura un inventaire des types et sous-types de cellules dans le corps, de leur emplacement, de leur évolution au cours du temps pendant la santé et la maladie, et des gènes activés dans chaque cellule.

Cette carte de référence serait une ressource ouverte que les scientifiques pourraient utiliser pour soutenir leur propre recherche.

Certains chercheurs ont comparé l'initiative au projet sur le génome humain (HGP) - qui a catalogué la séquence génétique humaine complète - bien que le nouveau projet soit confronté à de nombreux défis uniques.

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"Les types de données à collecter dans chacune des populations cellulaires individuelles et dans chaque cellule seront beaucoup plus diversifiés, et il y aura d'énormes défis dans l'intégration des données qui n'auront peut-être pas été aussi complexes. le HGP, "Justin Balko, Pharm.D., Ph. D., professeur adjoint de médecine et de biologie du cancer au Centre médical de l'Université Vanderbilt, a déclaré à Healthline dans un courriel.

Des chercheurs du Wellcome Trust Sanger Institute, du Broad Institute du MIT et de Harvard et d'autres institutions ont entamé des discussions initiales à Londres à la mi-octobre sur ce à quoi ressemblerait cette carte.

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Le groupe s'est déjà engagé dans le financement de l'initiative Chan Zuckerberg, qui a récemment annoncé qu'elle vise à «guérir, prévenir ou gérer toutes les maladies d'ici la fin de ce siècle. "

Lire la suite: À quel point l'initiative de 3 milliards de dollars de Chan Zuckerberg va-t-elle aider? »

Analyse de cellules individuelles

L'Atlas des cellules humaines sera aidé par une nouvelle technologie conçue pour analyser des cellules individuelles.

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En 2012, Aviv Regev, Ph. D., du Broad Institute, et ses collègues ont utilisé cette technologie pour examiner un petit groupe de cellules immunitaires appelées cellules dendritiques. Parmi ces cellules apparemment identiques, trois ont activé des gènes différents des autres.

"Nous avons été immédiatement stupéfiés", a déclaré Regev à The Atlantic "C'était comme si nous pensions que tout le monde dans une ville portait des chemises vertes, et il s'est avéré que certaines portaient du bleu et d'autres du jaune. "

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Elle a trouvé une variation encore plus grande quand elle a examiné plus de 1 700 cellules dendritiques.

Le coût de ces technologies a considérablement diminué ces dernières années, ce qui devrait accélérer le projet.

Selon The Atlantic, Regev a dépensé en 2012 des milliers de dollars pour analyser seulement ces 18 cellules dendritiques. Un an plus tard, le prix était tombé à 10 dollars par cellule.

D'autres méthodes permettent maintenant aux chercheurs d'analyser des centaines de milliers de cellules en même temps - à seulement 6 cents par cellule.

Avoir une image complète ou un catalogue de tous les types de cellules dans les tissus normaux nous aidera finalement à déterminer quelles cellules se transforment en cancer. Justin Balko, Centre médical de l'Université Vanderbilt

Cette approche plus détaillée de la compréhension des tissus a de nombreuses applications potentielles, comme dans la recherche sur le cancer.

"Avoir une image complète ou un catalogue de tous les types de cellules dans les tissus normaux nous aidera à déterminer quelles cellules se transforment en cancer, et basé sur leur biologie, cela conduira sûrement à de meilleures thérapies", a déclaré Balko.

Les chercheurs qui utilisent des cellules souches pour régénérer des tissus endommagés ou perdus pourraient également en tirer profit. Comment savez-vous ce qu'il faut construire si vous ne savez pas quels types de cellules se trouvent dans un tissu?

Même l'utilisation de CRISPR pour éditer l'ADN pourrait être facilitée par une meilleure compréhension du fonctionnement et de l'interaction des cellules en guidant les chercheurs vers les bons gènes à éditer.

Ce ne sont pas tous les chercheurs contactés par Healthline qui étaient au courant de l'initiative Atlas des cellules humaines. Il est donc possible que l'impact de ce projet prenne un certain temps.

Pourtant, certains chercheurs sont optimistes quant au potentiel.

"Ce sera très excitant de voir comment le projet se déroulera", a déclaré Balko.«À mesure que de nouveaux détails deviendront disponibles, bon nombre d'entre nous commencerons à réfléchir à des orientations précoces pour utiliser ces données passionnantes afin de faire progresser notre compréhension de la biologie du cancer et du développement de nouvelles thérapies contre le cancer. "

Lire la suite: Le traitement des gènes CRISPR est approuvé pour le traitement du cancer»