Des résultats de recherche erronés: des anticorps pourraient être en cause

La recherche scientifique est seulement aussi bonne que les outils utilisés pour réaliser les expériences.

Donc, avec l'un des outils scientifiques les plus répandus qui fonctionneraient de manière cohérente dans seulement 49% des cas, de nombreux scientifiques sont concernés.

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L'outil? Anticorps fabriqués sur mesure.

Comme les anticorps produits naturellement par le système immunitaire en réponse à un envahisseur comme une bactérie ou un virus, les anticorps personnalisés se lient à des cibles moléculaires spécifiques.

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Cela aide les scientifiques à comprendre comment les maladies se développent et à trouver de nouvelles façons de les traiter ou de les diagnostiquer.

Mais seulement si les anticorps fonctionnent comme annoncé.

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"Les anticorps doivent être testés pour s'assurer qu'ils détectent la protéine d'intérêt et seulement cette protéine", Deborah Berry, Ph.D., professeure adjointe de recherche et codirectrice de l'histopathologie et des tissus Ressources partagées à l'Université de Georgetown, a déclaré à Healthline.

Cette "validation" peut être faite par l'entreprise qui fabrique l'anticorps, par le chercheur, ou par un laboratoire spécialisé comme celui de Berry.

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Comment les anticorps sont-ils défectueux?

Les anticorps imparfaits peuvent prendre de nombreuses formes.

Un anticorps peut se lier à des protéines autres que la cible visée. Ou à aucune protéine du tout.

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Les conditions expérimentales - comme les solutions utilisées - peuvent également affecter le fonctionnement d'un anticorps.

Même le même type d'anticorps produit dans des lots séparés - ou provenant de sociétés différentes - peut donner des résultats différents.

Un «résultat» avec un anticorps peut être très différent d'un «résultat» avec un autre anticorps. Deborah Berry, Université de Georgetown

«En tant que tel, un« résultat »avec un anticorps peut être très différent d'un« résultat »avec un autre anticorps, même lorsqu'il est effectué avec les mêmes échantillons dans les mêmes conditions».

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Des anticorps imparfaits peuvent également créer des maux de tête importants pour les scientifiques.

Dans un cas, mis en évidence dans la revue Nature, des chercheurs de l'hôpital Mount Sinai de Toronto, au Canada, ont utilisé un anticorps provenant d'un kit commercial de détection de protéines pour créer un test du cancer du pancréas.

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Ils ont finalement réalisé que l'anticorps ne se liait pas à leur protéine cible. Au lieu de cela, il collé à une autre protéine du cancer.

Le résultat? Deux années de travail acharné, des milliers d'échantillons de patients et 500 000 $ dans les égouts.

Un des chercheurs a dit à Nature que, pressés de poursuivre leur recherche, ils n'avaient pas réussi à s'assurer que l'anticorps fonctionnait comme promis.

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Système de notation des anticorps

Si le contrôle de la qualité des anticorps est si important pour l'intégrité de la recherche scientifique, s'assurer que ça arrive?

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"En termes de validation, il appartient vraiment au producteur / vendeur et à l'utilisateur final, i. e. Leonard Freedman, Ph.D., président de l'Institut mondial de normes biologiques à but non lucratif (GBSI), a déclaré à Healthline dans un courriel.

Mais ce n'est pas un gros secret dans la communauté scientifique que certaines entreprises vendent des anticorps "merdiques".

C'est pourquoi de nombreux scientifiques préconisent des anticorps commerciaux plus performants.

"Les entreprises doivent être tenues à des normes plus élevées pour s'assurer que les anticorps de mauvaise qualité ne parviennent pas sur le marché", a déclaré Berry.

Lors d'une réunion la semaine dernière à Asilomar en Californie, organisée par GBSI, plus de 100 experts biomédicaux ont proposé une solution possible aux anticorps inférieurs - créer un système de notation qui indique aux scientifiques la fiabilité des anticorps d'une entreprise.

Les scientifiques de la réunion - ainsi que les représentants de l'industrie et du gouvernement - se sont mis d'accord sur une stratégie visant à créer des lignes directrices pour la validation des anticorps de recherche. Ces normes façonneraient le système de notation.

Actuellement, il n'existe pas de lignes directrices standardisées et largement acceptées pour la validation des anticorps.

Les participants à la réunion d'Asilomar espèrent qu'une meilleure validation des anticorps permettra d'économiser temps et argent.

Cela améliorera également la reproductibilité de la recherche - la capacité des scientifiques à obtenir les mêmes résultats lorsqu'ils réexécuteront une expérience.

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Une meilleure formation pour les scientifiques

Une feuille de route sur la certification des anticorps et sur la meilleure façon pour les scientifiques de sortir de la réunion formés pour utiliser des anticorps.

Un sondage mené l'année dernière par GBSI a conclu que plus de la moitié des chercheurs n'étaient pas formés à l'importance de la validation des anticorps.

Les scientifiques plus jeunes étaient encore plus susceptibles de ne pas tenir compte de cette étape clé.

Jusqu'à présent, le système de notation des anticorps reste sur la planche à dessin, mais la pression des coins droits pourrait aider à le faire avancer.

"En termes de mise en œuvre ou de conformité des normes, les bailleurs de fonds, les revues et même les institutions hôtes devraient jouer un rôle critique", a déclaré M. Freedman.

Selon Berry, cela pourrait signifier que le scientifique doit démontrer - soit en distribuant la documentation de l'entreprise ou en laboratoire - que l'anticorps utilisé dans l'expérience détecte correctement la protéine d'intérêt. "

Les principales revues médicales et les National Institutes of Health (NIH) ont déjà pris des mesures pour résoudre le" problème de reproductibilité "."Les mauvais anticorps, cependant, ne sont qu'une partie de cela.

Et valider et marquer les millions d'anticorps vendus par des douzaines d'entreprises ne serait pas facile - ou bon marché.

"Il est coûteux de prendre tous les anticorps par une validation complète, et l'entreprise aurait besoin de transmettre ce coût au client", a déclaré Berry. "Le coût de la validation augmente le coût des anticorps et réduit la capacité d'une entreprise à être compétitive pour ses clients. "

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